1、壓力控制

實驗室通風系統中，需要考慮壓力控制，通常的生物化學實驗室都要求保證實驗室負壓，防止實驗室產生的毒害氣體流入臨近的辦公區域，形成穿插污染。

2、便當日后的改造或擴建　

控制系統的設計應該盡量思索日后的改造和擴建。使得通風柜等設備的更新、移位、增加，實驗室壓力性的變換等盡量簡單。

3、易維護

過于復雜的系統，常常需求定期維護，維護程序復雜并且費用高。所以一個良好的控制系統應該盡量簡單牢靠，維護簡單或者不需定期維護。

4、溫馨

保證實驗室適宜并且穩定的溫濕度，氣流穩定無異味，為實驗室的工作人員提供一個溫馨的工作環境，以進步工作效率。

5、安全

安全要素能夠保證實驗室內操作人員安全，以及保證實驗室周邊環境安全。各國關于實驗室安全都有較為細致的標準，而安全也是實驗室重要的目的之一。